申し訳ありませんが現時点では、自動集計には対応しておりません。
「給与ソフト向けデータ」で出力できるのは1ヵ月単位の集計結果です。

日ごとの集計データが確認できる「素データ」を利用して、ファイル出力後にExcelなどで加工して集計をお願いします。